DESENVOLVIMENTO DE SERVIDOR SEMI-AUTOMÁTICO DE MODELAGEM MOLECULAR

Autores

  • João Luiz De Almeida Filho
  • Jorge Hernandez Fernandez

Palavras-chave:

Bioinformática, Modelagem, Modeller

Resumo

A modelagem molecular de estruturas protéicas é uma vertente em amplo desenvolvimento dentro da Bioinformática hoje, mas a usabilidade destes aplicativos ainda é complexa e requer conhecimentos avançados de linguagem computacional. No intuito de facilitar a experiência de trabalho com modelagem molecular, o nosso grupo está desenvolvendo uma interface gráfica para o programa de modelagem estrutural de proteínas Modeller, o AutoModel.O AutoModel está sendo desenvolvido atualmente nas linguagens de programação Python e wxPython, sob o Sistema Operativo Kubuntu Linux e Modeller versão 9v6. Como modelo de desenvolvimento está utilizando-se o modelo incremental, possibilitando a melhor adaptação deste aplicativo a outros sistemas e a adição de novas funções. Internamente ele está estruturado em duas camadas. Uma camada (Cliente) responsável pela interface gráfica e pelas chamadas ao servidor, e uma segunda camada (Servidor) onde ficarão os arquivos de trabalho e o Modeller. A interface gráfica está sendo desenvolvida para ser amigável aos usuários inexperientes, possibilitando a obtenção de resultados com maior eficácia.Nos testes feitos com o AutoModel percebeu-se claramente que a modelagem utilizando o AutoModel ficou mais simples e objetiva se comparada à modelagem utilizando o Modeller de forma convencional. Quando a camada Servidor do AutoModel estiver pronta, o sistema poderá ser utilizado por pesquisadores de outras instituições via WebDepois de seis meses de desenvolvimento, a camada Cliente está totalmente funcional, facilitando a interação do usuário com o programa, e esta pronta para ser utilizada na Pós-Graduação do CBB. O próximo passo será o desenvolvimento da camada do servidor, e a comunicação entre os dois sistemas. 

Publicado

03-04-2012